在晴朗明媚的一天羊村正舉行防禦係統揭幕儀式這是慢羊羊村長的最新發明該係統可以抵製上千伏的電壓誰知這時灰太狼突然出現攪局不久前他發明了羊味罐頭由此成為當今最炙手可熱的科學家可是沒能抓到小羊依然是他心中隱隱的傷痛灰太狼操縱天氣控製器與羊羊特工隊展開殊死搏鬥受傷的喜羊羊偶然結識了熊貓旺財而對方的真實身份是滅絕了許久的蛇受挫的灰太狼專心升級天氣控製器卻忽略了老婆和灰灰的感受而他的失誤也導致天氣控製器失控危難時刻青青草原的各位意外發現久遠以前蛇族發明的諾亞神舟可是為了啟動神舟必須得到蛇族的幫助為此羊羊特工隊和機械喜羊羊踏上凶險莫測的冒險旅程……本片為《喜羊羊與灰太狼》係列第五部劇場版動畫